MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	GCG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017637	CCGGC	2	10	44	53	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017637	GGC	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017637	GTC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017637	GCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017637	CCG	2	6	228	233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017637	CGC	2	6	310	315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017637	GT	3	6	356	361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017637	GCA	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017637	GCC	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017637	G	6	6	441	446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017637	AGG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017637	CTC	2	6	640	645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017637	TCAG	2	8	698	705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017637	TG	3	6	1272	1277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017637	AAT	2	6	1587	1592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017637	CCGCC	2	10	3565	3574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017637	GCA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017637	GGT	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017637	GCG	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017637	CGG	2	6	5463	5468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017637	CGT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017637	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017637	CCT	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017637	GGCAC	2	10	5762	5771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017637	GGA	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017637	CGG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017637	GCC	2	6	6351	6356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017637	GCCT	2	8	6378	6385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017637	AGG	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017637	GCG	2	6	6408	6413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017637	TGT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017637	GGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017637	GTC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017637	GCT	2	6	6551	6556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017637	CCG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017637	CGC	2	6	6657	6662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017637	GT	3	6	6703	6708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017637	CCG	2	6	6743	6748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017637	CAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017637	A	6	6	6866	6871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017637	GTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017637	GAA	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017637	CAA	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017637	CAG	2	6	8468	8473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017637	CT	3	6	8949	8954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017637	CCG	2	6	8955	8960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017637	CTAT	2	8	8996	9003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017637	GGC	2	6	9308	9313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017637	AGG	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017637	T	6	6	10270	10275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017637	CAG	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017637	GAGCA	2	10	10284	10293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017637	AGC	2	6	10294	10299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017637	A	6	6	10761	10766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017637	TTTAT	2	10	10773	10782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017637	ATAA	2	8	10807	10814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017637	A	6	6	10819	10824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017637	GAA	2	6	10827	10832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017637	T	7	7	10840	10846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017637	GTG	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017637	ACC	2	6	10906	10911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017637	TTG	2	6	10920	10925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017637	CGT	2	6	10929	10934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017637	TTC	2	6	10937	10942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017637	GCG	2	6	10956	10961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017637	GT	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017637	GCC	2	6	11028	11033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017637	G	6	6	11068	11073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017637	TACA	2	8	11074	11081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017637	GTC	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017637	GAG	2	6	11308	11313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017637	T	8	8	12205	12212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017637	ATC	2	6	12218	12223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017637	ATG	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017637	TC	3	6	12600	12605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017637	ATC	2	6	12630	12635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017637	AACT	2	8	12639	12646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017637	ATG	2	6	12689	12694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017637	ATTT	2	8	20532	20539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017637	GTT	2	6	20586	20591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017637	ATT	2	6	20604	20609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017637	CAG	2	6	20664	20669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017637	TAT	2	6	20686	20691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017637	TCT	2	6	20711	20716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017637	ACT	2	6	20720	20725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017637	ATA	2	6	21667	21672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017637	AGTT	2	8	21717	21724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017637	TTG	2	6	21773	21778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017637	GCGG	2	8	21805	21812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017637	TGGT	2	8	21866	21873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017637	A	7	7	21944	21950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017637	T	7	7	21968	21974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017637	AGT	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017637	GGT	2	6	22162	22167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017637	GCT	2	6	22168	22173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017637	GAT	2	6	22286	22291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017637	ATC	2	6	22302	22307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017637	AGT	2	6	22319	22324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017637	T	7	7	22626	22632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017637	TAAT	2	8	22650	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017637	AATG	2	8	22677	22684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017637	ATT	2	6	22749	22754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017637	AT	3	6	22768	22773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017637	TTG	2	6	22824	22829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017637	CAGA	2	8	22849	22856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017637	GAT	2	6	22904	22909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017637	AAT	2	6	22968	22973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017637	ATA	2	6	23013	23018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017637	TGT	2	6	23033	23038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017637	CAAA	2	8	23041	23048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017637	GCT	2	6	23080	23085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017637	TA	3	6	23705	23710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017637	TC	3	6	23742	23747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017637	AT	3	6	23767	23772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017637	CA	3	6	25985	25990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017637	TTAA	2	8	25995	26002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017637	AGG	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017637	T	7	7	31533	31539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017637	GAA	2	6	31566	31571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017637	CCT	2	6	32553	32558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017637	AT	3	6	33033	33038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017637	A	7	7	33059	33065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017637	A	6	6	41419	41424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017637	A	7	7	41430	41436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017637	CCG	2	6	41440	41445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017637	G	6	6	41462	41467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017637	ACAG	2	8	44815	44822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017637	GAT	2	6	44823	44828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017637	GTTT	2	8	44829	44836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017637	AAAT	2	8	44859	44866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017637	ATT	2	6	44910	44915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017637	CTGG	2	8	44923	44930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017637	GTC	2	6	44938	44943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017637	ATG	2	6	44997	45002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017637	CGA	2	6	45010	45015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017637	ATA	3	9	45761	45769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017637	AAC	2	6	47037	47042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017637	T	6	6	47066	47071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017637	TCC	2	6	47920	47925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017637	T	6	6	47972	47977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017637	AAT	2	6	47989	47994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017637	GTT	2	6	48026	48031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017637	ATG	2	6	48060	48065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017637	TGC	2	6	48078	48083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017637	GGC	2	6	48180	48185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017637	TCG	2	6	48191	48196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017637	ATCAC	2	10	54092	54101	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.